EVENTO
DockTData: Integração Automatizada de Dados de Afinidade de Ligação e Estruturas Moleculares para a Modelagem da Interação ReceptorLigante
Tipo de evento: Defesa de Dissertação de Mestrado
O presente trabalho tem como objetivo desenvolver e validar um pipeline automatizado para a integração de dados estruturais e energéticos de complexos receptorligante, visando apoiar a modelagem computacional de interações moleculares e a predição de afinidade de ligação. A metodologia fundamenta-se em uma arquitetura ETL (Extract, Transform, Load), com extração automatizada de dados provenientes das bases públicas Protein Data Bank, BindingDB e ChEMBL, seguida de etapas de normalização de unidades, validação de registros e padronização de identificadores moleculares, como SMILES, InChI e InChIKey. A integração dos dados é realizada apenas quando há correspondência estrita entre estruturas experimentais e valores de afinidade, assegurada por critérios de identidade de sequência e verificação dos ligantes.Como resultado, foi gerado um conjunto de dados integrado contendo mais de 20 mil estruturas do PDB e aproximadamente 10 mil ligantes distintos, majoritariamente pequenas moléculas de interesse farmacológico, associados a parâmetros de afinidade como Ki, Kd, IC50 e EC50. O conjunto final apresenta alto grau de confiabilidade e coerência entre os dados estruturais e os parâmetros de afinidade, estando em conformidade com os princípios FAIR de encontrabilidade, acessibilidade, interoperabilidade e reuso. Conclui-se que o DockTData constitui uma infraestrutura escalável e reprodutível para a integração de dados moleculares, com potencial aplicação no desenvolvimento de modelos preditivos baseados em aprendizado de máquina e em estudos de bioinformática estrutural, contribuindo para o avanço da descoberta racional de fármacos.Evento HíbridoLocal: Auditório ALink de transmissão: meet.google.com/rtf-ekfg-dib
Data Início: 25/02/2026 Hora: 14:00 Data Fim: 25/02/2026 Hora: 17:00
Local: LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica - Auditorio A
Aluno: José Renato Duarte Fajardo - - LNCC
Orientador: Isabella Alvim Guedes - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Laurent Emmanuel Dardenne - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Participante Banca Examinadora: Daniela Barretto Barbosa Trivella - Laboratório Nacional de Biociências - LNBio/CNPEM Fabio Lima Custodio - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Hugo Verli - - UFRGS Laurent Emmanuel Dardenne - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Suplente Banca Examinadora: Antônio Tadeu Azevedo Gomes - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
